检查发酵桶、曝气管支架、曝气管、过滤袋、循环管路、外挂发酵桶等部件是否清洁，特别是桶底、桶壁有无沉淀、污染物。
向发酵桶内倒入20升左右清洁水。
将扩增机发酵桶注液口循环软管断开，与外挂发酵桶进液管连接，外挂发酵桶出液管与扩增机发酵桶大循环注液口连接，检查管路连接的牢固性。
注意：外挂发酵桶出液管任何位置不能高于出液口位置。
从发酵菌包内取出菌种和培养料，将培养料分批次倒入洁净溶解桶（容量10-20升）内，加入3-5倍（以形成流动液体、方便过滤为原则）清洁水，充分搅拌均匀后经10目甚至60目过滤袋倒入发酵桶内。
继续加清洁水至刻度线（50升）。
可加入中微量元素，得到生物螯合营养菌液，钙镁1.0-2.0%，微量元素0.1-0.2%。
关闭外挂发酵桶底部排污阀门。
开启水泵，料液逐渐泵入外挂发酵桶内。
准备发酵补料，将发酵补料分批次倒入洁净溶解桶内，加入3-5倍（以形成流动液体、方便过滤为原则）清洁水，搅拌均匀后经10目甚至60目过滤袋倒入发酵桶内；一边添加料液，一边同时将料液泵入外挂发酵桶内。
一般发酵补料的添加量为20-30Kg/桶（200升），不要过多，菌液太粘稠，会影响水泵的运转甚至损坏水泵。
当全部补料添加完成后，将80目过滤袋放入支撑网内，固体菌种直接倒入过滤袋。
菌种和培养料混合一体的菌包可省略此步骤。
继续加入清洁水，料液会从外挂发酵桶上部出液口溢出，继续加水至扩增机发酵桶刻度线，此时扩增机发酵桶和外挂发酵桶总液量为约250升。
将过滤袋封口紧固于曝气管支架顶部，曝气管插入过滤袋底部。
连接供气管，调节供气管阀门，盖上扩增机上盖。
供气管阀门一般打开三分之一，分配曝气管与曝气盘通气量。
检查管路连接，开启气泵、加热器开关，开始扩增36-48小时。
扩增结束后，打开扩增机自流或泵流放液口，打开外挂桶下部排污阀，放出菌液；也可以将外挂发酵桶底部排污口与扩增机自流出液口连接，关闭循环阀门，再通过水泵、加热器、将菌液泵出。
清洗扩增机、发酵桶、外挂发酵桶及相关配件；部件恢复原位，备用。
应该及时清洗，防止长时间结垢，造成清洗困难。
不要用硬质工具清洗发酵桶内部，以免损坏部件，特别是曝气盘橡胶膜。
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